Згідно регламенту змагань 28.11.2006 ФК „Спартак” (Суми) виключено зі складу ПФЛ, а команду знято з розіграшу першості з анулюванням результатів вже зіграних матчів.
Невиконання ФК „Борисфен” (Бориспіль) постанов Бюро ПФЛ від 28.12.2005 р., 07.02.2006 р., 16.05.2006 р., 05.12.2006 р., 19.12.2006 р., 30.01.2007 р., КДК ФФУ від 26.05.2006., 11.08.2006 р., 29.12.2006., та Апеляційного комітету ФФУ від 14.06.2006. щодо сплати заборгованості футболісту Руслану Левізі та постанови Бюро від 30.01.2007 р. щодо виконання фінансових зобов’язань перед футболістом Олександром Дмитруком змусило членів Бюро ПФЛ зняти з ФК „Борисфен” 6 турнірних очок
Команда „Поділля” Хмельницький позбавлена 3 турнірних очок згідно рішення КДК ФФУ від 25.05.2007 р.